Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC106Q9BWC9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms