Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTTNBP2Q8WZ74 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms