Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms