Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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