Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms