Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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