Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMAN2Q12907 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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