Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPCQ01831 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms