Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGDP52209 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGDP52209 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms