Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms