Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms