Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRAP18433 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms