Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POP4O95707 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POP4O95707 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POP4O95707 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POP4O95707 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POP4O95707 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POP4O95707 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POP4O95707 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POP4O95707 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms