Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRATO95237 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRATO95237 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRATO95237 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRATO95237 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms