Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CACNA1GO43497 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms