Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MBD1Q9UIS9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms