Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SNX15Q9NRS6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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