Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSPNQ9HAW4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms