Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117382.1-201ENST00000438702 754 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMS3-207ENST00000445033 1120 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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