Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms