Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTF1AQ7RTS3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms