Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MED27Q6P2C8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MED27Q6P2C8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MED27Q6P2C8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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MED27Q6P2C8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MED27Q6P2C8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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