Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms