Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms