Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP170Q5SW79 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms