Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms