Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCN9AQ15858 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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