Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB3P14651 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms