Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-EP13747 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-EP13747 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms