Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP9BO43861 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms