Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLH3Q9UHC1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms