Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms