Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM61Q5EBN2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms