Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Siah2Q06986 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms