Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA6P31267 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms