Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
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PTPRMP28827 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRMP28827 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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