Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRT3P12035 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT3P12035 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT3P12035 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms