Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms