Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMUO75648 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMUO75648 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMUO75648 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMUO75648 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms