Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdfS4R2K0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdfS4R2K0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms