Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptgdr2Q9Z2J6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptgdr2Q9Z2J6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms