Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cldn3Q9Z0G9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldn3Q9Z0G9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms