Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dnaja4Q9JMC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaja4Q9JMC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms