Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col4a3bpQ9EQG9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col4a3bpQ9EQG9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms