Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmd12Q9D8W5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psmd12Q9D8W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmd12Q9D8W5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psmd12Q9D8W5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms