Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ribc1Q9D0B8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ribc1Q9D0B8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ribc1Q9D0B8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms