Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf9Q9D0B0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf9Q9D0B0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms