Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RpainQ9CWY9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RpainQ9CWY9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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