Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gnpda2Q9CRC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gnpda2Q9CRC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnpda2Q9CRC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms