Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epdr1Q99M71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epdr1Q99M71 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epdr1Q99M71 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms